1、公告。在土地利用项目申报中，项目所在县(市)土地行政主管部门应牵头组建土地利用项目权属调整领导小组，负责协调本项目权属调查与调整的有关事宜。从土地利用项目区域确定之日起至项目实施完毕、土地权属调整终结，项目所在地土地行政主管部门应进行土地权属调查公告。从公告之日起，应停止办理项目区域内土地权利转移及权利设定登记等手续，禁止任何个人或单位在项目区内从事一切影响土地利用的非正常农业生产活动。

2、调查。县(市)土地行政主管部门应在上级部门批准项目立项后，对项目区进行详细的土地利用现状和权属调查。

(1)调查土地权属(所有权和土地使用权)现状：查明土地产权的主体、具体的边界；明确有没有土地权属纠纷，若有纠纷必须在项目开工前解决。

(2)土地权属调整意愿调查：对项目区内所有土地产权的主体进行是否同意工程实施和土地产权调整的意愿调查。

(3)工程意愿与范围公告：将调查结果，包括同意进行施工和土地权属调整的土地产权主体个数及其所占面积，反对进行施工和土地权属调整的土地产权主体个数及其所占面积，项目区土地类型和范围等情况向产权人主体进行公告。

(4)地籍测量与土地利用现状调查：对项目区内的土地利用现状进行调查，并进行地籍测量，查明每一个土地产权主体所拥有的土地的位置、面积。

3、评价。

(1)施工前土地质量评价：对项目区内不同土地产权主体所拥有的土地质量进行评价，确定土地质量级别，为项目完成的土地权属调整做好准备。

(2)竣工后土地质量评价：工程竣工后，对项目区反映土地质量状况的指标包括耕层厚度、土壤剖面结构、土壤质地、土壤养分含量、土壤盐碱状况、土壤污染状况、地下水埋深、灌排条件、田间道路、田面平整程度等进行测定和评价。一方面是检查工程是否按规划设计要求进行施工；另一方面是评定竣工后土地质量状况，确定工程完成前后土地质量的变化情况，为制定土地权属调整方案服务。

4、调整。

(1)土地权属调整方案编制：根据地籍测量与宗地权属调查、施工前土地质量评价、工程竣工后土地质量评价，编制土地权属调整方案。主要内容包括：项目区内土地权属状况，产权调整的范围，工程组织实施单位或部门与土地权利人签订的协议。在分配土地权益时，应保证项目区范围内原有土地权利人权益不减少。土地权属调整方案应征得三分之二以上土地权利人的同意。

地界插花的，由产权双方协商，在插花地带以明显地物为标志划界区分，使插花地块面积大致相抵，多出地块作为调整用地，经双方签订换地协议，竣工后即以协议确认土地产权。对于飞地，可以通过协调和置换，将原飞地重新确权给飞地所属产权人。因涉及田坎、道路、沟渠等变化而需要调整土地权属界限的，可根据工程规划先行测算分摊占地面积，经产权各方签订协议，采取差额面积就近调换的方法调整。

(2)方案公告和异议处理：土地权属调整方案应当在项目区内进行公告。对权属调整方案有异议的土地产权人，应于公告期内书面提出，经协商不能解决的，争议由当地人民政府调处。集体经济组织内或农民对土地承包经营权调整有异议的，应在公告期内向村集体经济组织或乡(镇)人民政府提出，争议由村集体经济组织或乡(镇)人民政府调处。涉及他项权利者，应通知他项权利人参与调处。经调处后仍有不同意见者，由仲裁部门裁定或上诉当地法院。

(3)分配土地及地籍档案整理：按照经公告和异议处理后的土地权属调整方案分配土地。土地登记部门应及时进行土地变更调查和土地变更登记，建立新的地籍档案，并妥善保管有关土地登记资料。